《心跳源計劃》的結局是情感與犧牲的交織，展現了主角們面對愛情、責任和犧牲的複雜情感。以下是主要角色的結局：
莫莉：因被周小山多次拒絕，最終選擇接受一個致命任務，在周小山的懷中犧牲，她的死成為了劇情的一個重要轉折點。
周小山：在意識到自己的愛情和責任後，周小山決定不再逃避。他將小卉託付給裘佳寧，並選擇與查叔同歸於盡，以此來保護裘佳寧和源計劃。他的犧牲不僅是對愛情的極致表達，也是對責任的堅守。
裘佳寧：作為源計劃的核心成員，裘佳寧在劇中展現了出色的才華和堅定的意志。她與周小山的感情經歷了從對立到合作的轉變，最終兩人共同為源計劃貢獻力量。
小卉：在劇情中扮演了重要的角色，她的存在讓周小山的犧牲更加深刻。周小山的決定不僅是為了保護裘佳寧，也是為了保護小卉和香蘭的安全。
查叔：作為劇中的反派角色，查叔的計劃最終被周小山的犧牲所阻止。他的失敗標誌著正義的勝利。
整個劇情通過這些角色的故事，探討了愛情、責任和犧牲的主題。周小山的犧牲不僅是對愛情的極致追求，也是對責任和正義的堅守。他的選擇雖然悲壯，但也是對未來充滿希望的開始。