清洗美妝蛋的方法有多種，以下是一些常用的方法：
使用專門的清潔劑。將美妝蛋用大量的水充分打溼，然後倒上適量的美妝蛋清潔劑，輕柔地按壓清洗直至殘留化妝品溶解。然後用流動的清水徹底沖洗乾淨，直至沒有泡沫。
使用清潔皁。將美妝蛋完全浸泡，然後用清潔皁輕輕揉搓。注意控制好力度，以免損壞美妝蛋。當泡沫變回白色時，證明美妝蛋中的彩妝已經洗淨。
使用洗面奶或牙膏。將美妝蛋放入塑料袋中，加上洗面奶、牙膏、卸妝油和少量水，然後揉搓幾下。
日常存儲與收納。避免在密封及潮溼環境下儲存美妝蛋，不要存放在浴室裏，以減少細菌滋生。使用後應用蛋架收納在乾燥通風的地方。
在清洗美妝蛋時，需注意以下幾點：
避免使用尖銳物品（如指甲）接觸美妝蛋，以免劃破。
不要用洗潔精清洗美妝蛋，因爲洗潔精可能會損害其質地。
清洗後，用衛生紙或洗臉巾吸掉多餘的水分，然後置於陰涼通風處自然晾乾，避免直接暴曬，以防美妝蛋變形或損壞。
建議的清洗頻率是每週1到2次，如果每天使用，可考慮每三天清洗一次。使用超過2到3個月後，建議更換新的美妝蛋。