清洗美瞳的方法有以下幾種：
揉搓法。首先將美瞳放置於掌心，手掌呈碗狀托住鏡片；然後將美瞳護理液滴入掌心，沒過鏡片，用食指在掌心內揉搓鏡片；用拇指和食指托住鏡片，用大量的美瞳護理液沖洗鏡片，同時用手指來回搓洗鏡片；最後將鏡片放回盒子中，倒入新的護理液。
搖晃法。首先在鏡盒中倒入足夠的護理液，將剛脫下來的美瞳放入鏡盒中；然後蓋緊盒蓋，左右搖晃鏡盒1分鐘，以移動美瞳上的沉積物；注意要左右搖晃，避免上下搖晃，以免鏡片摺疊；定期清洗美瞳盒，確保存放環境衛生。
自動清洗法。使用美瞳自動清洗盒，將美瞳放入清洗盒並按下按鈕操作；清洗盒會按照一定的頻率振動，以達到清潔美瞳的目的。
使用電動牙刷清洗。將美瞳放在鏡盒中，然後利用電動牙刷的震動去清洗美瞳；清洗後，將美瞳放入盒子中，倒入新的護理液。
在清洗美瞳時，需要確保雙手清潔，避免留過長指甲以免劃傷鏡片；清洗後，應將美瞳放在乾淨的盒子中晾乾，不要使用毛巾擦拭。