慈祐宮是一個歷史悠久的廟宇，它有許多故事和傳說。以下是其中一些：
1. 太子娘子顯聖：相傳，有一次鄭莊公得知自己得子，他聽聞孩子出生時就特異，於是在產後第一時間親自前往宮裡看望兒子。看著小兒鄭昭，莊公決定為其賜名“世子”。而在世子周歲時，京城突然下起了大雨，伴隨著轟隆的雷聲，城北的祥光異彩顯現。有七位美麗的仙女，自空而降，跪拜在世子床前祝賀他長命百歲。其中一位還抱著一個裝滿書的錦囊贈予他。此時突然一位婢女急忙闖進，說太子娘子已經過世。莊公大驚失色，立刻派能手為太子娘子入殮發喪。第二天莊公去參拜墓地時，發現有一座宮殿已經完工，並稱“慈祐宮”。據說這就是慈祐宮的由來。
2. 金龍換柱傳說：在慈祐宮的修建過程中，發生了一件奇事。據說負責監工的官員用一根金條換了四柱四梁的木料。完工後，原本木製的神像被換成金像，但神像的眼睛卻無法製作完成。當夜，有神靈託夢給官員：“我是某星之魂，某星之魄，某星之靈。因為你們誠心修建廟宇，我特來相助。”於是第二天，官員在附近的山上發現了一對天然大眼睛。自此之後，這裡就成了慈祐宮香火鼎盛的福地。
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