懷石料理的享用方式通常遵循一定的順序和禮儀，以下是懷石料理的上菜順序和食用方式：
順序。通常先上米飯、湯和配菜，接着是煮菜、燒菜、湯、下酒菜，最後是米湯或鹹菜，有時會以點心結束。
餐具使用。在享用懷石料理時，使用筷子，忌用筷子扎食物，避免用手直接端盤中的食物。
食用方法。從淡白色的食物開始喫，逐漸過渡到貝類和紅肉類，整條魚從後脊部開始喫，保持原樣取下骨頭後食用身體部分。
特殊菜品。如生魚片，芥末不溶於醬油，應少量沾取後放在生魚片上，大葉也一併食用。燉菜（炊き合わせ）通常由客人中地位較高者先打開蓋子欣賞後，再由其他人打開蓋子品嚐。
結束部分。餐後會提供點心和抹茶，日式甜點用小木叉切成一口大小食用，抹茶用雙手端着茶碗慢慢品嚐。
懷石料理的享用不僅是一種味覺的享受，也是一種文化和禮儀的體驗。