《拳皇99》中包含多個角色，其中一些主要人物包括：
K'。遊戲的主角之一，K'的命運與庫利扎里德緊密相連。
庫利扎里德。作為N.E.S.T.S.的小幹部，庫利扎里德的命運在遊戲中扮演重要角色。
MAXIMA。一位強大的女性戰士。
矢吹真吾。他是主角隊的一員，以其卓越的戰鬥技巧著稱。
莉安娜。她是八神庵的隊友，以其強大的力量和複雜的背景故事而聞名。
痲宮雅典娜。作為超能力戰士隊的一員，雅典娜以其超能力而聞名。
此外，還有如二階堂紅丸、泰瑞·伯格、安迪·伯格、東丈、坂崎獠等角色。這些角色各自擁有獨特的戰鬥風格和背景故事，為遊戲增添了豐富的層次和深度。