摩利支天心咒的功德主要包括以下幾點：
修習摩利支天法門可以感應到種種功德，如沒有人可以加害修煉者、欺負修煉者、綁架修煉者、霸占修煉者的財物金錢等，以及一切冤家仇敵不能傷害修煉者。
修煉摩利支天心咒可以去除一切障礙，包括盜賊的災難、政治迫害、官司、口水是非等。在各種道路中，修煉者會得到保護，遠離野獸、猛虎、毒蛇、毒蟲的傷害，以及水火等災難。
修煉摩利支天心咒還可以去除一切鬼魅靈體的傷害，使修煉者遠離災難，戰勝一切怨家惡人。
修煉摩利支天心咒還可以增長一切吉祥，如去除病痛、求長壽、獲得大智慧、增長他人對修煉者的敬愛等。
修煉摩利支天心咒還可以滅除一切罪業，成就無上菩提道，實現一切所欲所求。
此外，摩利支天心咒在歷史上也被多位高僧大德所推崇和使用，如南宋高宗曾供奉摩利支天，並在戰亂中得到其庇護。