日本是一個位於西太平洋的島國，由四個主要島嶼（北海道、本州、四國、九州）和6800多個小島嶼組成。國土總面積為37.8萬平方千米，形狀大致為東北向西南延伸的弧形。日本列島周圍被海完全包圍，沒有與任何國家的陸地相連。
日本的地形以山地和丘陵為主，約75%的國土屬於山地丘陵地帶，而小規模的山間盆地及平原則散布全國，是居民居住、耕種和經濟活動集中的地方。日本最高的山峰是富士山，位於本州島，海拔3776米，雖然自1708年以來沒有再大規模噴發過，但仍然是一座活火山，被日本人尊稱為「聖岳」。
日本的氣候主要是溫帶和亞熱帶季風氣候，夏季炎熱多雨，冬季寒冷乾燥，四季分明。日本還是世界上降水最多的地區之一。
水文方面，日本的河流流程短、流域面積小、落差大，因此水流湍急。最長的河流是信濃川，長約367公里，而最大的湖泊是琵琶湖，面積672.8平方千米。
自然資源方面，日本較為貧乏，除了煤炭、天然氣、硫磺等極少量的礦產資源外，其他工業生產所需的主要原料和燃料都需要從海外進口。儘管如此，日本的森林資源豐富，森林覆蓋率占陸地面積的69%，是世界上森林覆蓋率最高的國家之一。漁業資源也很豐富，北海道和日本海是世界著名的大漁場，盛產700多種魚類。
經濟上，日本是全球重要的經濟體之一，以高科技產業如汽車、鋼鐵、工具機、造船、電子、機械、半導體和機器人等在全球具有競爭優勢。科研、航天、醫療、教育、製造業等領域均居世界前列。日本的文化產業和旅遊業也非常發達，以動漫、音樂和遊戲產業為代表，同時保留了茶道、花道、書道等傳統文化。