日本房子持有成本主要包括以下幾個方面：
購房階段的費用：
中介費：如果是二手房，需要支付3%加6萬日幣的中介服務費。
其他稅費：包括過戶登記費、印花稅、不動產取得稅、火災地震保險費等，大約占房價的2%-3%。
持有房產階段的費用：
固都稅：根據房產評估價值繳納。
物業管理費：公寓需要支付，包括房屋維修費用、共用部分清潔費、保險費用等。
修繕基金：公寓需要支付，隨著房子年份的增加，修繕基金的費用會提高。
貸款利息：如果通過貸款購買房產，需要支付銀行等機構的貸款利息。
稅費：包括房產稅和城市規劃稅，根據房屋的市場價值、土地面積和房屋結構等因素計算。
修繕費：包括小修補費用和大修費用，如門窗更換、牆面刷漆、屋頂維修等。
其他雜費：如水電費、煤氣費、網路費等日常生活費用。
其他費用：
租賃管理費：如果房產出租，還需要支付租賃管理費，大約是租金的5%。
房屋代管理服務費：如果將房產委託給房屋中介代管，會產生此費用。
收入所得申報的服務費：房產出租時，需向稅理士支付辦理收入所得申報的服務費。
固定資產稅和都市計劃稅是每年繳納一次，具體計算規則和繳納頻率可以參考相關資料。