日本武士的姓氏系統非常複雜，主要包括以下幾個部分：
氏(Clan Name)。這是武士的最高級別姓氏，通常與他們的家族或祖先有關。例如，源氏和平氏都是日本歷史上非常著名的氏族，源氏與清和天皇的血脈有關，而平氏則出自桓武天皇的後代。
姓(Family Name)。在日本武士中，姓通常與他們的家族或祖先有關，如「源」「平」「藤原」「橘」和「豐臣」等。其中，「豐臣」是後來由織田信長創造的。
苗字(Personal Name)。這是武士的第二個層次的名字，通常與他們的家族或祖先的居住地、特徵或職業有關。例如，斯波氏、畠山氏和細川氏等。
通稱或官位(Title)。這是武士的第三個層次的名字，通常由他們的功績或職位決定，如「日向守」等。
本名(Personal Name)。這是武士的日常用名，也是他們最廣為人知的名字。
此外，日本武士的姓名中還可能包含法號、戒名等。在幕府時代，武士享有「苗字帶刀」的特權，這意味著他們擁有攜帶武器的權利。明治維新後，日本普通民眾也開始被允許擁有姓氏，但這些姓氏往往反映了他們的居住環境或職業。