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普氏分析法

普氏分析法(Procrustes Analysis)是一種用於分析形狀分布的統計方法,主要用於比較兩組數據的一致性,展示樣品不同方面的數據關聯度。其過程如下:

對原始數據進行降維。

通過降維結果分布進行「中心疊加、大小縮放、圖形翻轉、形狀比較」等變換過程,將兩組學數據的樣本分布疊加在同一個低維空間,計算點坐標之間的偏差平方和(M2值)。

打亂樣本點分布,重新計算M2值。基於原始M2值在抽樣分布中的出現機率,計算顯著性P值。

計算對應點坐標之間的偏差(稱為矢量殘差),矢量殘差越小代表了兩數據集具有更高的一致性。

普氏分析在宏基因組測序轉錄組測序物種分類等領域有廣泛套用,例如用於解釋細菌組成與耐藥基因的相關性、基因與表型的相關性,以及不同基因對物種鑑定的一致性。