木瓜籽的處理方式有多種，主要分為食用、種植和藥用等方面。
食用木瓜籽的方法如下：
清洗木瓜籽，去除外層的薄膜和雜質。
可以選擇將木瓜籽煮熟、晾乾後加鹽食用，或者用牛奶煮熟後加入蜂蜜食用。
在某些文化中，木瓜籽也被用於釀造酒或用於烹飪。
種植木瓜盆栽的方法如下：
將清洗乾淨的木瓜籽晾乾，去除外層的薄膜。
將種子浸泡在水中，每天換水，直到種子發芽。
將發芽的種子植入土壤中，保持適當的濕度和溫度，等待其成長。
藥用方面，木瓜籽具有抗癌和抗菌特性，以及緩解關節炎疼痛等功效。在某些情況下，木瓜籽也被用於製作草藥產品。