李莫愁的武功水平很高，幾乎在五絕級別之下難以找到對手。具體來說，她的武功實力算是江湖一流水平，僅次於丘處機，和朱子柳差不多。在《神鵰俠侶》中，李莫愁的武功可以排在一流高手中的中等水平。
李莫愁有兩樣讓武林談之色變的絕學：冰魄銀針和令人聞風喪膽的毒。她的武功以控制為主，兵不血刃便可制敵，比較適合遠程作戰或偷襲。然而，與五絕以及裘千仞、周伯通等頂尖高手相比，她還是稍遜一籌。但不可否認的是，李莫愁在江湖中也是一位令人聞風喪膽的女魔頭。
總的來說，李莫愁的武功水平很高，在一流高手中占有一定的地位，但並非頂尖高手。