二分裂
根瘤菌通過二分裂的方式進行繁殖，這是一種無性繁殖方式，其中一箇細菌分裂成兩個細菌。
根瘤菌的繁殖過程不依賴於氧氣，它們可以在微氧或無氧條件下進行繁殖，這是因爲根瘤菌具有厭氧代謝能力，能夠利用有機物代謝產生能量。根瘤菌在土壤中通常通過豆科植物的根毛分泌的有機物吸引而聚集在其周圍，並大量繁殖。當根瘤菌侵入豆科植物的根皮層時，會刺激宿主皮層細胞分裂，進而形成根瘤。根瘤內部含有大量根瘤菌的細胞羣，這些細胞羣與宿主細胞共同作用，不僅能夠固氮，還將分子氮還原成NH3，併合成酰胺類或酰尿類化合物，這些化合物由根的傳導組織運輸至宿主地上部分供利用。