正乙祠戲台兩側柱子上的對聯是「演悲歡離合,當代豈無前代事;觀抑揚褒貶,座中常有劇中人。」 這副對聯不僅是傳統戲曲藝術的真實寫照，而且緊密聯繫著正乙祠的前世今生，以及在這裡來來往往的無數名伶和票友，蘊含著深刻的意味。
此外，根據民國時期的《梨園外史》記載，正乙祠戲樓在早期曾有一副不同的對聯，這副對聯隱含了四出崑曲名劇《蝴蝶夢》、《琵琶記》、《桃花扇》和《燕子箋》。這表明正乙祠戲樓最初主要是為崑曲表演而建的。然而，目前展示的對聯與早期記載的對聯不同，這可能是因為後來北昆接手正乙祠戲樓的運營後，重新掛上了這副對聯，而朱家溍先生所寫的對聯則被藏在了它身後。