製作水果酵素的過程通常包括以下步驟：
準備材料。需要純淨水、紅糖（或蜂蜜）、水果，比例通常為紅糖（或蜂蜜）：水果：水=1：3：10。常見的水果包括蘋果、葡萄、梨、水蜜桃、柚子等。
清洗消毒。用流動的水清洗水果，確保無農藥殘留，然後用開水燙洗消毒。
切割水果。去皮去核，將水果切成小塊或薄片。
混合材料。將切好的水果和紅糖（或蜂蜜）放入容器中，加入純淨水直至充滿容器的大約80%，留下20%的空間以防止發酵時溢出。
發酵過程。密封容器，每天搖動或攪拌一次以促進發酵和混合材料，前一個月需要每天開蓋放氣，之後可以密封，讓酵素繼續發酵2到6個月。
過濾和儲存。發酵完成後，使用乾淨的紗布或過濾網過濾掉固體物質，將液體倒入乾淨的瓶子中儲存。
食用方法。每天早晚飲用，按照1:5的比例兌入水或蘇打水，也可以直接飲用。
不同的水果酵素可能有略微不同的製作方法和食用效果，可以根據個人喜好和需求進行調整。