沉井下沉的方法主要包括以下幾個步驟：
布置樁基。首先在地面布置樁基，確保沉井下沉的位置和深度準確無誤。
挖掘井身。在樁基布置完成後，開始挖掘井身。應先清理樁身上的泥土和雜質。
下放沉井。將預製的沉井放入挖掘好的井身中，然後通過降低水位等方法使其逐漸沉降至設計要求的深度和位置。沉降過程中需即時測量並記錄數據，以便及時做出調整。
封閉沉井。下沉完成後，進行封閉工作，包括防水處理和對沉井四周的加固固定。
沉井下沉的方法可以分為排水下沉和不排水下沉兩種：
排水下沉適用於滲水量不大或排水方便的土層，如黏土、砂礫層。常用的方法有明溝集水井排水、井點排水等。
不排水下沉適用於嚴重的流砂地層和滲水量大的砂礫層，以及地下水無法排除或大量排水會影響附近建築物安全的情況。不排水下沉主要使用高壓水槍沖土法和抓鬥挖土法。
沉井下沉的過程中，應採取措施助沉，如下降過程中應動態化管理下沉狀況，進行下沉的監測和控制，及時分析和檢驗土的阻力與沉井重力的關係。此外，根據土層條件和沉井自重，可能需要採取壓重或接高沉井等方法助沉。