洱海污染的原因主要包括以下幾點：
人口增長和農業種植結構改變。人口的增加和農業種植結構的調整，特別是大水大肥的種植模式，導致了大量富含氮、磷的農田尾水流入洱海，造成了污染。
養殖業和工業的擴展。奶牛等養殖業的發展以及周邊工業的無序開發加劇了洱海的污染。
旅遊業發展。旅遊業的迅猛發展，包括民宿和餐館的無序搭建，直接或間接地將生活廢水排放到洱海中，導致水質惡化。
面源污染。面源污染，如入湖河流、農田徑流、畜牧養殖、垃圾營養物流失等，成為洱海的主要污染源。
水土流失和生物多樣性破壞。水土流失、生物多樣性的破壞進一步加劇了洱海的污染問題。
此外，洱海污染的原因還有城鎮化加速、人口進一步聚集、社會生產經營活動的增加等。