淡水清水祖師故事有以下幾種說法：
* 清水祖師化身幫助漁民的故事 。一天，清水祖師在海邊散步，看到遠處漁船上有人向他招手求救。他循著招手的方向走過去，發現是一位老婦人躺在地上抽搐不止，身邊還有幾個小孩不知所措。清水祖師上前詢問並得知老婦人一家誤食了有毒的海鮮，清水祖師立即取水給她解毒。之後，清水祖師便離開了，但臨行前許諾說會送一株茶樹給老婦人以表感謝。漁民們發現這株茶樹長出了茶葉，泡出來的茶香甜可口，這便是“清水祖師茶”的由來。老婦人後來得了眼病，清水祖師便用香蕉葉包裹茶葉，點燃熏過老婦人的眼睛，她立刻恢復了光明。漁民們便將此法傳承下來，發明了鹽水治療法 。
* 清水祖師保庇淡水漁業** 。在很久以前，淡水附近漁民出海捕魚時都會遭受各種意外和災難，漁獲也日益減少。為了求平安和增加漁獲，漁民們便建了一座廟宇，供奉清水祖師，並在他面前許願。清水祖師便以各種方式保庇淡水漁業，如驅逐惡勢力、保護漁船平安等。
以上就是清水祖師在淡水的幾個故事，這些故事體現了人們對美好生活的嚮往和追求。