深圳公交卡的退卡流程如下：
普通成人卡的退卡。持卡人可以前往6家深圳通自營客服網點或51家深圳市郵政支局進行退卡處理，沒有卡內餘額的限制。對於押金版卡，如果卡表面完好（無摺疊、斷裂、彎曲、塗鴉、異物貼上或刻劃模糊等情況），押金會全額退還。如果卡表面損壞，押金將部分扣除。紀念版卡不包含押金，購卡費用不予退還。如果卡不可讀取，需從後台處理，十天後通過微信轉賬等方式領取退款。
學生卡的退卡。持卡人需攜帶學生卡及辦理該卡時的身份證原件，前往6家深圳通自營客服網點或51家深圳市郵政支局進行退卡處理。對於在深圳聯通辦理的2.4G深圳通學生卡，僅支持在112家深圳聯通自營門市退卡。
需要注意的是，一旦深圳通卡辦理了退卡，該卡就不能再次使用，也沒有重新激活的可能，因此在決定退卡前需仔細考慮。