辨別糖心瑪瑙真假的方法主要包括以下幾點：
觀察顏色和紋理。天然糖心瑪瑙的顏色純淨自然，分布均勻，並有絲帶過渡，看起來和諧。表面通常有紅色斑點，光澤明亮。而假糖心瑪瑙的顏色可能會堆積重，顏色不均勻，看起來生硬且暗淡。真正的糖心瑪瑙經過長期風蝕作用，表面可能有不均勻的風化線，表皮凹凸不平，坑窪大小不一，但坑內的光澤與坑外一致。
質地和比重。天然糖心瑪瑙的內部結構緊湊，質地柔軟細膩且濕潤，摸起來光滑柔軟。而假貨的內部結構可能鬆散，質地粗糙，摸起來乾澀。天然糖心瑪瑙的質地緻密且堅硬，密度高，比重大，在同體積的情況下，放在手上會有一定的壓手感，而假貨的密度小，比重明顯輕。
觀察內部結構和雜質。天然糖心瑪瑙形成時間較長，內部可能有團裝或霧狀的晶體結構，這是其獨特特性。而假貨內部可能幹淨或有少量氣泡。
價格。天然糖心瑪瑙的價格相對較高，而人工合成的價格可能較低。
證書。天然的糖心瑪瑙可以出具珠寶鑑定證書，而人工合成的很難出具證書。
通過這些方法，可以較為準確地判斷糖心瑪瑙的真假。