在《火影忍者》中，存在多種特殊的瞳術，主要可以分為以下幾類：
寫輪眼。這是宇智波一族的血繼限界，可以通過強烈的情緒刺激開眼，並不斷進化。在經歷至親之人的死亡後可以進化成萬花筒寫輪眼，進一步通過移植親人的萬花筒寫輪眼融合成永恆萬花筒寫輪眼。
輪迴眼。被稱為「掌控生死之眼」的最高瞳力，是起源於神樹查克拉果實的究極瞳術。輪迴眼的擁有者可以掌控陰陽，擁有超凡的能力，既可以是具有創世能力的創造之神，也可以是具有滅世能力的毀滅之神。輪迴眼也是唯一能夠防禦和破解無限月讀的方法。
白眼。這是日向一族所擁有的血繼限界，起源於大筒木一族的瞳術。白眼具有360°的視角，能夠看清對方的經絡、穴道、人體查克拉流動情況，具有強大的洞察力。
轉生眼。需要結合大筒木一族的查克拉與日向一族的白眼才能開啟，是白眼進化的終點，具有毀滅創世之力。
淨眼。只有博人展現過的奇特瞳術，能夠發現附在他人身上的異常查克拉。
仙人眼。進入仙人模式後，身體會仙人化，根據所吸收自然能量性質的不同而產生不同的變化。
九尾眼。進入九喇嘛模式後出現的特殊瞳孔，具有特殊的查克拉表現。
血龍眼。血之池一族的血繼限界，其能力在《佐助真傳》中登場。
以上是《火影忍者》中主要出現的瞳術類型，每種瞳術都有其獨特的能力和背景故事。