烏龜水腫的處理方法取決於其原因。一般的治療方法包括：
幹養處理。將烏龜放置於冷開水中每天浸泡兩次，每次約30分鐘，這有助於治療水腫。
使用抗生素。可以在水中加入抗生素對烏龜進行治療，有助於水腫的快速消失。
改善飼養環境。例如，將臉盆側立放置，使烏龜能在無水的區域曬太陽，同時可以在水中加入阿莫西林膠囊粉進行治療。
調整飼料。如果是由於食物引起，如餵食過多或含鹽分高的食物，應減少餵食或改善食物結構，避免餵食鹹食。
處理消化不良。對於消化不良引起的水腫，可以停食並使用助消化藥物。
處理外傷。對於外傷引起的水腫，可以使用聚維酮碘溶液進行消炎處理。
治療泌尿系統疾病。如果是泌尿系統問題引起的水腫，可以喂服金錢草顆粒或其他利尿藥物。
治療肺炎。對於肺炎引起的水腫，可以將抗生素摻入龜糧或進行藥浴治療。
處理器官衰竭。對於器官衰竭引起的水腫，可能需要注射利尿藥物，並餵食新鮮草藥。
根據烏龜的具體情況選擇合適的治療方法，嚴重時建議尋求專業獸醫的幫助。