燕州在歷史上曾多次設立，其位置也隨時間的推移而有所變化：
在北魏孝文帝太和十一年（487年），燕州被設立，其治所在今昌平區東南沙河鎮辛力莊。然而，到了孝昌元年（525年），由於杜洛周兵變，燕州被廢。
在唐初，燕州再次設立，這次寄治在幽州城內（今北京市區西南）。後來，燕州治所遷移到幽州北桃谷山（今昌平區東境桃峪口附近），並在天寶元年（742年）改爲歸德郡，乾元元年（758年）複稱燕州。但到了建中二年（781年），燕州被廢入幽都縣。
另外，唐貞觀三年（629年）在廣西也設立了一箇名爲燕州的州，其治所在武林縣（今廣西平南縣武林鎮），後因地理位置調整，燕州被撤銷。
燕州城，又稱白巖城，位於遼寧省遼陽燈塔市西大窯鎮城門口村東的石城山上，是東晉元興二年（403年）高句麗佔據遼東城（今遼陽）後所建的軍事城堡。
綜上所述，燕州的位置隨歷史時期的不同而有所變化，包括北京昌平區、廣西平南縣以及遼寧省遼陽燈塔市等地。