牛疫苗免疫程式根據牛的不同年齡和性別分為幾種不同的方案。以下是牛疫苗免疫程式的一個概述：
犢牛。在1日齡時，未採食初乳前，注射牛瘟弱毒苗，隔1至2小時後讓犢牛吃初乳。7至15日齡時，注射氣喘病苗。10日齡時，注射傳染性萎縮性鼻炎疫苗。20日齡時，注射牛瘟苗。25至30日齡時，注射偽狂犬病弱毒苗。35至40日齡時，在疫區，首免後隔3至4周再進行一次注射，注射犢牛副傷寒菌苗。60日齡時，注射牛瘟、肺疫、丹毒三聯苗。
經產母牛。在空懷期，注射牛瘟、牛丹毒二聯苗或牛肺疫的三聯苗。每年春季3至4月份，肌注乙腦苗。產前2周，肌注氣喘病滅活苗。產前45天和15天，分別注射大腸桿菌苗。產前35天，皮下注射傳染性萎縮性鼻炎滅活苗。
配種公牛。每年春季和秋季，各注射一次牛瘟、牛丹毒二聯苗或加牛肺疫的三聯苗。
後備公牛、母牛。配種前1個月，肌注細小病毒疫苗。配種前20至30天，注射牛瘟、牛丹毒二聯苗或加牛肺疫的三聯苗。每年春季3至4月份，肌注乙型腦炎疫苗一次。配種前1個月接種偽狂犬疫苗。
此外，還有其他疾病的防疫措施，如口蹄疫、牛傳染性胸膜肺炎、牛鏈球菌病等，具體疫苗和免疫程式根據疾病發生情況和地區差異有所不同。