醃製疙瘩鹹菜的方法有多種，以下是一種常見的醃製方法：
準備新鮮的芥菜疙瘩，挑選個頭適中、無蟲眼的芥菜疙瘩。用清水清洗芥菜疙瘩，去除表面的泥土和雜質。
將清洗乾淨的芥菜疙瘩削去根部的根須和莖蒂，處理掉有坑髒的部位。
將芥菜疙瘩切成絲或小塊，使用擦絲器或刀切。
把切好的芥菜疙瘩放入盆中，加入適量的鹽，翻拌均勻，醃製10分鐘左右，讓芥菜疙瘩出水。
準備調料，如大蒜切末、辣椒片和辣椒粉、芝痲等。
鍋內加油燒熱，炸制蔥油，將蔥條炸至金黃微焦。
將熱蔥油分次淋入裝有辣椒的小盆內，一邊淋油一邊攪拌辣椒，使辣椒受熱均勻。
醃製好的芥菜疙瘩撈出，放入紗布內，紮緊口，擠出水分。
將擠乾水分的芥菜疙瘩放回盆中，加入白醋、白糖、味素、蒜末和炸好的辣椒油。
戴上一次性手套，將芥菜疙瘩和調料充分翻拌均勻。
把拌好的芥菜疙瘩裝進玻璃罐子或保鮮盒內，蓋上蓋子，放入冰櫃冷藏保存，或放在陰涼處保存。
醃製3天後即可食用。
不同地區和家庭可能會有不同的醃製方法和風味調整，但基本步驟大致相同。