清潔硅藻泥牆面時，可以根據污漬類型採取不同的清潔方法：
對於灰塵，由於硅藻泥不易產生靜電，所以不會像某些材料那樣容易吸附灰塵。日常清潔只需用軟布或雞毛撣子輕輕擦拭即可。
對於有色液體如咖啡或橙汁的污漬，應儘快用乾淨的抹布或紙巾吸乾，然後根據污漬的嚴重程度選擇處理方式。如果污漬較淺，可以使用含氯漂白劑輕輕擦拭；如果污漬已經滲透或擴散，需要等待其乾透後，局部刷水性底油，再覆蓋上同色的硅藻泥。
對於手印、腳印或筆跡，可以使用橡皮擦或細砂紙輕輕擦拭去除。
需要注意的是，對於掛塵或積灰，不宜使用溼抹布進行清潔，因爲溼布可能會損壞硅藻泥的表面結構。同時，避免使用含氨的清潔劑，以免損壞硅藻泥。