磷壁酸是革蘭氏陽性菌細胞壁的主要組成成分，具備多種重要的生理功能。主要包括：
濃縮細胞周圍的二價陽離子（如$Mg^{2 +}$）。磷壁酸的分子帶有大量負電荷，能夠提高細胞周圍$Mg^{2 +}$的濃度，從而增強細胞膜上一些合成酶的活性。
作為貯藏磷元素的倉庫。磷壁酸內部儲存了磷元素，為細胞提供必需的磷營養。
調節細胞內自溶素的活力。這有助於防止細胞因自溶而死亡，保持細胞結構的完整性。
作為噬菌體的特異性吸附受體。這一功能使得磷壁酸在噬菌體感染過程中發揮關鍵作用。
增強某些致病菌對宿主細胞的粘連。這有助於避免被白細胞吞噬，以及抵抗宿主的免疫系統。
賦予G+細菌特定的抗原。這些抗原對菌種的鑑定和免疫識別至關重要。
此外，磷壁酸還與細胞的生長和分裂密切相關，通過調節自溶素的活力來阻止細胞壁的過度降解。