祖沖之的故事有很多，以下是其中兩個：
1. 圓周率計算：據說，祖沖之親手設計並製造了各種數學用的簡儀和曲圓儀，其中一種巧妙的圓弧導線測量儀器，就有一部分木結構仍然保留。他取得觀測數據後，進行運算求出圓周率的具體數值，經過多年的測算，祖沖之求出圓周率在3.1415926和3.1415927之間，是當時世界上最先進的數學成果。
2. 農業機械創造：有一次，祖沖之看到農夫在用人力礱磨，就把這項任務交給了學生魯蕭。魯蕭仿照人力礱磨製作了一架木頭製造的用水力礱磨，並用它在短時期內加工出了大量的麻與穀物。這件事傳開後，農民紛紛要求為自己仿製。於是祖沖之建議南徐州刺史蕭繹官府可以大量製造，推廣使用。
祖沖之堅信實踐是檢驗真理的唯一標準，他對於傳統的“周三徑一”說提出了自己的看法，並用實際數據進行推算，證明了《周髀算經》中有關圓周率的記載是錯誤的。他的這一結論在當時是極具顛覆性的突破。
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