科研方法的三要素主要包括：
研究對象：這是科研活動的核心，包括但不限於人、動物、細胞、組織、器官等。在實驗設計時，需要明確受試對象的品種、年齡、體重、來源、數量、性別等特徵。
處理因素：指根據不同的研究目的而給研究對象施加的各種干預措施。處理因素包括生物因素、化學因素、物理因素及內外環境因素。
試驗效應：指實驗過程中受試對象產生的效應，也就是我們常說的觀察指標。這些效應一般都應反映在科研項目的題目中，如某科研項目題為「觀察某降壓藥物的降壓效果」，從這裡我們不難看出，在這一研究中，研究對象是高血壓患者，處理因素是降壓藥物，試驗效應是測量的血壓值。
以上三要素共同構成了科研方法的基本框架，缺一不可。