糖心蛋的製作方法有多種，以下是一種常見的做法：
將雞蛋從冰櫃中取出，放置至室溫，然後洗淨備用。
在鍋中加入足夠的水，加入一點白醋和鹽，加熱至水開始冒密集氣泡，約40至60秒。
將雞蛋放入鍋中，煮7分鐘。
煮好後，將雞蛋立即放入冷水中，以停止烹飪過程。
冷卻後，剝去蛋殼。
可將剝殼的雞蛋放入滷汁中，置於冰櫃中浸泡一段時間（如2天至一晚上），以便充分吸收滷汁的味道。滷汁的製作是將鹵包、水、醬油、冰糖、辣椒等材料放入鍋中浸泡20分鐘後煮滾，放涼備用。
這樣製作的糖心蛋蛋黃仍然保持半熟狀態，而蛋白已經煮熟，可以根據個人口味調整滷汁的配方和浸泡時間。