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缺口平移法

缺口平移法(Nick Translation)是一種用於標記雙鏈DNA探針的技術,它依賴於DNA聚合酶I的多種酶促活性,將標記的三磷酸脫氧核糖核苷酸(dNTP)摻入新合成的DNA鏈中,從而產生高比活性的均勻標記DNA探針。

其基本原理是,先用DNA酶I在DNA探針的一條鏈上打開一個或多個缺口(nick),在缺口處形成3'端羥基。隨後,利用大腸桿菌DNA聚合酶I的5'→3'外切酶活性,將缺口5'端的核苷酸依次切除。同時,在大腸桿菌DNA聚合酶I的5'→3'聚合酶活性的催化下,以另一條DNA鏈為模板,以dNTP為原料,將dNTP順序連線到缺口的3'端羥基上。這樣,隨著缺口的移動,標記的核苷酸就摻入到新合成的DNA鏈中,替代了原DNA分子上的部分核苷酸。

這種方法適用於線狀、超螺旋以及帶缺口的環狀雙鏈DNA。其優點包括快速、簡便、標記的探針均勻、特異性高,適用於較長的雙鏈DNA。然而,這種方法也有一些缺點,例如需要較多的DNA模板(>200ng),且標記效率較低。