《威尼斯船歌》的音樂和結構特點分析如下：
曲式結構。《威尼斯船歌》採用復三部曲式，整體結構分為引子、三個樂部和一個尾聲。第一樂部包含三個樂段，第二和第三樂部是第一樂部的變化再現。
和聲特點。該作品在引子、連線與尾聲處的和聲安排較稀疏，和聲進行以古典的、力量較強的四五度進行為主。引子結束在屬和弦上，連線則結束在下屬和弦上，這在當時的古典音樂中較少見。
旋律與音調。孟德爾頌的三首《威尼斯船歌》均採用小調，旋律具有多愁善感的悲歌式音調。主題旋律以級進為主，偶有跳進（四、六度）後馬上與反方向的級進進行相平衡，形成了「拱形」結構。
節奏型態。採用6/8拍典型的船歌節奏型態，展示了船在水中左右搖擺的畫面，體現了早期浪漫主義音樂如繪畫般描述性的特點。
結構和織體。採用半分解和弦的織體，結合了琶音分解和弦與節奏型分解和弦，使伴奏音型具有流動性和縱向的和聲效果。