芍藥和牡丹雖然都屬於牡丹科，但它們有以下幾個主要區別：
莖稈不同。芍藥是草本植物，其莖稈爲草質，相對較軟，而牡丹是木本植物，其莖部含有木質部分，比較粗壯且硬朗。
葉片不同。芍藥的葉片通常較細長，前端尖，不會分裂；牡丹的葉片則較寬厚，前端分裂，通常有2到3個裂口。
花朵不同。牡丹的花朵大多單生，花徑較長，可達20釐米，花型多樣，如單瓣型、荷花型、菊花型等，而芍藥的花朵常數朵叢生，花徑約15釐米，花型相對單一。
花期不同。牡丹的花期通常在4月中下旬，而芍藥則晚大約半個月，通常在5月上中旬開花。
綜上所述，雖然芍藥和牡丹在外觀上有相似之處，但它們在莖稈、葉片、花朵以及花期等方面都有明顯的區別。