莫高窟和敦煌石窟實際上指的是同一個地方，但可以從不同的角度來理解它們的區別：
地理位置與歷史：
莫高窟位於河西走廊的西部盡頭，敦煌。它的開鑿從十六國時期至元代，前後延續約1000年，是中國古代文明的一個璀璨的藝術寶庫，也是古代絲綢之路上不同文明之間對話和交流的重要見證。
洞窟與藝術：
莫高窟現有洞窟735個，保存壁畫4.5萬多平方米，彩塑2400餘尊，唐宋木構窟檐5座。這些洞窟內繪、塑佛像及佛典內容，為佛徒修行、觀像、禮拜處所。敦煌石窟是建築、雕塑、壁畫三者結合的立體藝術。
區域劃分：
洞窟分南北兩區：南區492個洞窟是莫高窟禮佛活動的場所，北區243個洞窟主要是僧人和工匠的居住地，內有修行和生活設施如土炕坑、煙道、壁龕、燈台等，但多無彩塑和壁畫。
名稱與包含範圍：
敦煌石窟一名通常用以指莫高窟，是莫高窟、西千佛洞的總稱，有時也包括安西的榆林窟。敦煌石窟與山西大同雲岡石窟、河南洛陽龍門石窟並稱中國三大石窟。1961年國務院公布莫高窟、榆林窟為全國重點文物保護單位。
綜上所述，莫高窟和敦煌石窟實際上是同一個地方的不同稱呼。莫高窟更側重於描述具體的洞窟和藝術特點，而敦煌石窟則是一個更廣義的稱呼，包括了莫高窟以及其他相關的石窟。