菌落數是指在一定條件下，如培養基的營養成分、pH值、培養溫度和時間，以及菌種的需氧性等，每克或每毫升檢樣中生長出來的細菌菌落總數。
菌落數是對樣品中細菌污染程度的量化指標，通常用於評估食品、水樣或飼料等的衛生質量。例如，在食品工業中，菌落總數的測定可以用來判斷食品在生產過程中是否符合衛生要求，從而對樣品做出適當的衛生學評價。
一般情況下，菌落總數的多少在一定程度上標誌著食品衛生質量的優劣，菌落總數越多，說明食品被細菌污染的程度越重，食品可能越不新鮮。而水源或食品中的菌落總數超標可能會破壞食品的營養成分，加速食品的腐敗變質，使食品失去食用價值。