《薩爾達傳說》故事劇情廣泛，以下是其主要劇情：
1. 初始之民：主角海拉爾三世是米拉傑等英雄的孫子，身上流著拯救神與魔鬼的血。三世成長的故事，以及與英雄達爾達斯之女妮娜的愛情故事，是本作的主線。
2. 風之甬道：主角還是嬰兒，被風甬的老人收養，老人預言主角的命運是拯救被魔王索爾金特控制的王國。
3. 眾神的三角：眾神因海拉爾王國而消亡，神三角的出現引發眾人的關注，神三角與魔導器有關。
此外，它還包括四支英雄小說裡的主線故事，比如風之甬道、眾神的三角、鐘之塔、曠野之塔。其中有很多細節需要玩家去發掘和了解。
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