蚩尤的故事有：戰神、疫神、五氏首領、苗族祖先、亂世凶神。
相傳蚩尤是炎帝的得力戰將，也是炎帝的族親，他在與黃帝大戰時，一度令黃帝頗感狼狽。失敗後的蚩尤轉戰至東方沿海地帶，逐漸發展成今天苗族的祖先。蚩尤帶領著由巨人組成的大軍，向炎帝所在的中央政權發動了大規模的戰爭，並掀起連綿三個月的漫天黃沙，令中原百姓苦不堪言，雙方在涿鹿大戰，蚩尤戰死，疫神東來，中原百姓才得以安寧。
此外，因蚩尤被刻畫為凶神，過去苗族的遷徙史也被附會成凶神蚩尤在追擊苗族時的歷史。後來蚩尤被賦予了除妖、治病等功效，成為了疫神，現許多地方都存有祭拜蚩尤的活動。