蜜蜂死亡的原因有多種，主要包括以下幾點：
正常死亡：蜜蜂像其他生物一樣，會經歷生老病死。在春季新老交替的階段，老齡蜜蜂會自然死亡。低溫天氣可能導致蜜蜂不能出箱或者死亡後其他蜜蜂未能及時清理屍體。死亡的蜜蜂通常是乾癟瘦小發黑的，溫度升高後這種情況會恢復正常。
中毒：蜜蜂可能因農藥或有毒植物中毒而死亡。成年蜜蜂中毒的表現包括吐舌頭，強群死蜂多，弱群死蜂少，採集蜂數量突然大量減少。除草劑中毒的表現則不太明顯，可能導致老蜂壽命縮短，採集蜂數量減少，新蜂和幼蟲失去哺育和採集能力。
細菌性疾病：蜜蜂可能因飼料或飲用水污染而患上細菌性疾病。營養不良或發育不良也可能導致蜜蜂死亡。
勞累過度：夏季工蜂過度採集蜂蜜，壽命會大大縮短，直至精疲力盡而死亡。
疾病：蜜蜂可能因未得到及時預防和治療的小病而最終死亡。養蜂者通常會採取預防措施，如除蟎、防治巢蟲等。
被毒死：有人可能出於嫉妒或其他原因故意毒殺蜜蜂，這是不道德甚至觸犯法律的行為。
意外：自然災害如山洪、滑坡、運輸事故、颱風等可能導致蜜蜂死亡。
資源匱乏：在某些情況下，蜜蜂可能因缺乏食物和適宜的巢穴而死亡。