配位原子是指在配位化合物中直接與中心原子（或離子）配位的配位體的原子。
配位原子提供孤對電子，這些孤對電子被中心離子接受形成配位鍵。要判斷配位原子，首先要看配體中哪個原子提供了孤對電子，因爲配位鍵的形成依賴於這一過程。
常見的配位原子包括氟(F)、氯(Cl)、溴(Br)、碘(I)、氧(O)、硫(S)、氮(N)、碳(C)等。具體如下：
氟(F)、氯(Cl)、溴(Br)、碘(I)位於元素週期表的右上角第17族。
氧(O)和硫(S)位於第16族。
氮(N)位於第15族。
碳(C)作爲一箇特殊的例子，也參與配位。
在多齒配體中，可以有兩個或兩個以上的配位原子。例如，在[Co(NH3)4]SO4中，N原子是配位原子，而在[Co(NH2CH2CH2NH2)3]SO4中，乙二胺配體中的兩個N原子都是配位原子。
此外，具有較高電負性的原子更可能作爲配位原子，因爲它們更容易提供孤對電子。但電負性不是唯一決定因素，在某些情況下，需要使用紅外光譜和偶極矩分析等實驗方法來準確判斷配位原子。