金光善在《陳情令》中的死因是被自己的兒子金光瑤折磨致死。具體來說，金光瑤採取了極端的手段，讓金光善在女人床上死去，從而使他死後身敗名裂，難以享有清白之名。這一情節展現了金光善一生作惡多端的後果，以及金光瑤對他父親的深仇大恨。