《異形契約》講述了生化設計專家沃特·迪亞斯帶著新晉的醫學生雷普利踏上一艘外星船，試圖尋找到人體再生的方法，以便挽救地球人的生命，不料被阿里斯領銜的契約小隊圍攻。一番冒險，雖然順利完成任務的四人回歸地球，但他們所在小隊的成功引起了艾索隆公司更為邪惡的實驗者的注意，該實驗者就是專門製造出新一類型殺手的神秘人物，故事發展到這裡出現了一種名叫索菲亞的生物。這個名為索菲亞的生物最後幫助異形皇后誕下異形幼體，並由雷普利一一清除，在復仇過程中雷普利和沃特·迪亞斯關係也由複雜變得明朗，並彼此產生了情感。最終艾索隆星球的首領對所有手下下達了引爆自身自毀程式的命令後消失。
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