《生化奇兵 3：無限》的故事發生在哥倫比亞的1912年代，玩家將扮演一名叫做“The Big Daddy”的主角，他是一位機械改造人，身負重任，需要在新世界中探索並保護一個名為“Columbia”的神秘區域。
在這個神秘的世界中，玩家將遇到各種人物，並需要解決各種問題。與此同時，主角還必須防止“Infinite Rift”，一個能將生命轉化為純粹的能量、可以毀滅一切的神秘裝置，落入壞人之手。遊戲的結局取決於玩家的行為和選擇。
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