《半衰期：愛莉克斯》（Half-Life: Alyx）的故事圍繞著愛莉克斯這個角色展開。故事設定在《半衰期2》後的數年，她在虛擬現實領域進行探索和研究。
在這個過程中，愛莉克斯被捲入了一場突發的全球災難事件中，使得現實世界和虛擬世界之間的界限變得模糊不清。遊戲的主線故事涉及到她探索虛擬世界中的各種環境和場景，以及解決現實世界中的各種問題和挑戰。
此外，遊戲還包含許多支線任務和探索元素，玩家可以自由探索一些特定的區域或場景，與虛擬世界中的各種角色互動，了解他們的故事和背景。
總之，《半衰期：愛莉克斯》的故事融合了現實和虛擬兩個世界，為玩家提供了深度探索和探索的空間。玩家將扮演愛莉克斯的角色，經歷一系列的冒險和挑戰，最終揭開整個故事的真相。