HE染色的目的主要是為了在光學顯微鏡下更好地觀察和識別組織細胞的不同結構。
HE染色是一種在組織學、胚胎學、病理學教學與科研以及臨床診斷中廣泛套用的染色技術。這種染色方法包括使用蘇木精和伊紅兩種染料。蘇木精是一種鹼性染料，主要使細胞核內的染色質和胞質內的核酸呈現紫藍色；伊紅則是一種酸性染料，主要使細胞質和細胞外基質中的成分呈現紅色。通過這種方式，細胞核和其他細胞結構在顯微鏡下形成鮮明的對比，從而更好地顯示細胞的形態結構和某些化學成分含量的變化。例如，在肝臟HE染色切片中，可以觀察肝細胞的形態是否完整、胞核有無增大、肝小葉形態是否完整，以檢測藥物等刺激因素對肝臟的損傷作用。