黏膜免疫系統（Mucosal immune system, MIS）是機體免疫系統的重要組成部分，主要分布於呼吸道、胃腸道、泌尿生殖道黏膜下及一些外分泌腺體處的淋巴組織。這些淋巴組織執行局部特異性免疫功能，構成機體抵抗感染的第一道防線。MIS通過產生分泌型IgA（sIgA）和IgM，阻止微生物在黏膜上皮層駐紮繁殖，從而防止病原體進入機體。MIS還包含腸黏膜相關淋巴組織（GALT）、支氣管黏膜相關淋巴組織（BALT）、眼結膜相關淋巴組織（CALT）和泌尿生殖道黏膜相關淋巴組織（UALT），這些組織在抗病毒免疫反應中起著非常重要的作用。
MIS評分是一種評估免疫系統狀態的指標，它可以動態監測免疫狀態，提供健康人群患重疾風險預測評估，量化評估亞健康狀態，為臨床腫瘤患者、器官移植患者、自體免疫性疾病等患者提供實時免疫狀態監測，指導治療。