TA克隆的主要目的是：
獲得目的片段序列：通過PCR擴增得到的目的DNA片段可以方便地克隆到T載體中。
獲得大量片段：TA克隆能夠高效地擴增DNA片段，適用於需要大量相同DNA序列的場合。
保存片段：將DNA片段克隆到載體中，可以長期保存該DNA序列，避免其丟失。
克隆和測序：TA克隆也常用於PCR產物的克隆和隨後的測序工作。
提高克隆效率：T載體帶有3'端的突出「T」尾，能夠與PCR產物3'端非模板依賴添加的「A」尾相連線，從而提高克隆效率。
靈活性：TA克隆在選擇酶切位點時具有靈活性，如果某個位點不適合使用，可以選擇其他酶進行後續操作。
TA克隆的原理是利用Taq DNA聚合酶在PCR產物3'末端非模板依賴地添加一個「A」鹼基，而T載體具有3'端的「T」突出端，兩者可以通過A-T鹼基配對在連線酶的作用下連線，實現PCR產物直接插入到質粒載體的多克隆位點中。