《巫師 3：狂獵》的故事發生在威倫郊區的幽靈村落和諾維格瑞與群島等地區，並深入探索了主角傑洛特以及同伴的冒險。故事講述了主人公在一場狩獵女巫的宗教迫害行動中，意外導致他的師傅死亡。之後主人公得知一個惡勢力的罪行，為了拯救即將被邪靈毀滅的村莊，傑洛特將孤身前往敵方大本營展開營救。同時，主角需要和村中的男爵和議會等人打交道，還要探索幽靈村莊發生的離奇事件。遊戲主線結束後，將進入支線任務，主人公將體驗更豐富的角色互動和劇情，同時支線任務還會影響主角的親朋好友、固有性格等。最終故事會走向何方，取決於玩家所做的選擇。