五毒教的武功包括以下幾種：
基礎武功。五毒笛咒是五毒教的基礎武功，是一種遠程攻擊技能，能夠對目標及周圍小範圍造成傷害。
主動攻擊技能。陰風蝕骨和萬蠱蝕心都是遠距離攻擊技能，能夠造成小範圍傷害並有機率致纏。迷心蠱是一種主動輔助技能，可以給目標敵方上毒並使其提升受到毒攻的傷害效果。
被動輔助技能。馭毒術、百毒穿心和高級笛咒都是被動輔助技能，分別增加自身攻擊力、提升會心一擊機率和提高五毒笛咒的攻擊力。無形蠱和回魂秘咒分別是被攻擊時有機率使敵方中毒和當自身生命低於30%時，有一定機率清除所有異常狀態並獲得一個將受到傷害轉換成生命回復的護盾。
套路技能。索命訣、鳳凰絕殺和百鬼潛行都是五毒教的核心技能。索命訣是五毒教的核心突進技和破定技，鳳凰絕殺是多段連續強壓制打擊技能，百鬼潛行則是五毒教的核心技能，使用後會使得五毒進入隱身狀態。
此外，五毒教還有靈蛇刺骨、狂蜂追命等技能。