生態保護區是由政府或其他管理機構指定的區域，旨在保護自然資源、生態系統和棲息地免受人類有害活動的影響。
生態保護區的建立通常是爲了保護重要的野生動物棲息地、重要的生態系統、減少污染，並確保自然資源的長期可持續性。這類保護區可能包括公園、保護區、野生動物保護區等管理和保護區，通過法律、法規和政策來管理和保護，以防止對生態系統和動物棲息地的干擾或破壞。其主要目標是維持生態平衡，爲未來世代保護自然環境。
生態保護區可以劃分爲不同類型，包括具有特殊重要生態功能的區域、生態敏感脆弱區域、跨省域的區域、江河源頭區、重要水源涵養區、水土保持的重點預防保護區、江河洪水調蓄區、防風固沙區、重要漁業水域等。這些區域依照規定程序劃定一定面積，予以重點保護、建設和管理的區域。
此外，生態保護區不僅關注生態保護，還常常結合科學研究、教育、生產和旅遊等活動，以實現其生態、社會和經濟效益的充分展示。